中国水科院:日本沼虾miRNAs缺氧下的应答如何?

2016-07-23 21:26 来源:网友分享

  2016年07月23日讯 在这项研究中,中国水产科学研究院傅洪拓和戈贤平领衔的课题组运用小RNA测序,对日本沼虾在常氧和缺氧条件下miRNA组进行了系统分析,相关研究成果发表在CBP上,孙盛明博士是本文章的第一作者。

  在这项研究中,中国水产科学研究院傅洪拓和戈贤平领衔的课题组运用小RNA测序,对日本沼虾在常氧和缺氧条件下miRNA组进行了系统分析,相关研究成果发表在CBP上,孙盛明博士是本文章的第一作者。课题组对常氧和缺氧条件下日本沼虾四个组织(鳃、肝胰腺、肌肉、血细胞)混合物构建小RNA文库,测序共获得9,227,356条读数。其中4,293,155条与267个miRNAs有关,包括203个保守miRNAs,64个河虾特有miRNAs;此外,对miRNAs的长度分布和末端变化做了分析;受miRNA调控的靶基因参与大量生物过程和信号转导路径;使用miRNA微阵列分析,从四个混合虾组织中鉴定出880个共表达miRNAs,39个特异表达miRNAs,其中25个常氧条件下特异表达,14个缺氧条件下特异表达;定量结果显示,常氧和缺氧条件下8个miRNAs表达模式与测序数据保持良好的一致性。

  本项研究首次提供了大规模鉴定和描述日本沼虾miRNA及其潜在靶基因的数据库,并为进一步描述它们在缺氧过程多样性中的作用奠定基础。

  关于联川生物简介

  联川生物成立于2006年,经过多年的快速发展,已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的?Paraflo微流体定制化芯片平台,可以为科研用户提供从基因组,转录组,到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一,联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组,可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求,联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线,为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。

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