2016-07-23 21:26 来源:网友分享
2016年07月23日讯 在这项研究中,中国水产科学研究院傅洪拓和戈贤平领衔的课题组运用小RNA测序,对日本沼虾在常氧和缺氧条件下miRNA组进行了系统分析,相关研究成果发表在CBP上,孙盛明博士是本文章的第一作者。
在这项研究中,中国水产科学研究院傅洪拓和戈贤平领衔的课题组运用小RNA测序,对日本沼虾在常氧和缺氧条件下miRNA组进行了系统分析,相关研究成果发表在CBP上,孙盛明博士是本文章的第一作者。课题组对常氧和缺氧条件下日本沼虾四个组织(鳃、肝胰腺、肌肉、血细胞)混合物构建小RNA文库,测序共获得9,227,356条读数。其中4,293,155条与267个miRNAs有关,包括203个保守miRNAs,64个河虾特有miRNAs;此外,对miRNAs的长度分布和末端变化做了分析;受miRNA调控的靶基因参与大量生物过程和信号转导路径;使用miRNA微阵列分析,从四个混合虾组织中鉴定出880个共表达miRNAs,39个特异表达miRNAs,其中25个常氧条件下特异表达,14个缺氧条件下特异表达;定量结果显示,常氧和缺氧条件下8个miRNAs表达模式与测序数据保持良好的一致性。
本项研究首次提供了大规模鉴定和描述日本沼虾miRNA及其潜在靶基因的数据库,并为进一步描述它们在缺氧过程多样性中的作用奠定基础。
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