中山大学Cell子刊发布DNA研究新工具

2016-10-17 22:22 来源:网友分享

  2016年10月15日讯 DNA通常是螺旋梯一样的双螺旋,这种结构是最具代表性的生物学图标之一。实际上DNA还有一种独特的形态,那就是缠结在一起的四链体结构。在体外实验中,富含鸟嘌呤的DNA链很容易形成四链体。人们也发现人类活细胞含有这种G四链体(G-quadruplexes)结构。不过,G四链体在体内的明确构象及其生物学相关性一直存在争议,特别是端粒G四链体。

  中山大学的研究团队前不久在Cell Chemical Biology杂志上发表文章,向人们展示了一种能够特异性识别平行G四链体的新抗体。这种抗体可以用来进行基因组图谱分析,发现人类端粒中的平行G四链体。文章通讯作者是中山大学的黄志纾(Zhi-Shu Huang)教授和赵勇(Yong Zhao)教授。

  研究显示,单链抗体(single-chain variable Fragment,scFv)D1在体外和体内对平行G四链体有很高的选择性结合能力。研究人员用D1进行全基因组染色质免疫沉淀和深度测序,在人类基因组中揭示了形成平行G四链体的共有序列。他们还用D1鉴定了端粒的平行G四链体形成,并在人类细胞中调节了端粒的平行G四链体形成。这项研究表明,平行G四链体特异性抗体D1是鉴定G四链体及其形成的宝贵工具,有助于进一步研究G四链体在体内的结构和生物学意义。

  剑桥大学的研究团队上个月在Nature Genetics杂志上发表文章指出,G四链体往往位于基因(尤其是癌基因)的调控区域,可能在基因的启动和关闭中起重要作用。这些信息为癌症的诊断和治疗带来了新启示,有助于开发靶向性的新疗法。

  人们普遍认为G四链体参与了基础的生理和病理过程。中国科学院动物研究所的科学家们经过深入研究发现了一种独特的G四链体。这种G四链体具有一个鸟嘌呤空位(G-vacancy)。鸟嘌呤衍生物(比如生理浓度的GTP)将鸟嘌呤填入这个空位,可以实现显著的结构稳定性。

  为了揭开四链DNA的神秘面纱,伦敦帝国理工学院的研究人员开发了能够在活细胞中检测G四链体的荧光分子。他们在体外培养的人骨癌细胞中进行研究,用显微镜实时观察了荧光分子与四链DNA的相互作用。研究显示,这种荧光分子可以区别双螺旋DNA和四链DNA,因为它结合四链体时发光时间更长。

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