中科院Genome Research发表环状RNA新成果

　　2016年07月04日讯 环状RNA来自于外显子的反向剪接。通过选择性反向剪接和选择性剪接，一个基因位点可以生成多个环状RNA。中科院上海生命科学研究院的杨力（LiYang）研究员领导团队，为环状RNA的选择性反向剪接和选择性剪接绘制了详细图谱。这项研究发表在七月一日的GenomeResearch杂志上。

　　研究人员对此前开发的计算分析流程进行了升级（CIRCexplorer2）。他们将这个工具用于不同的细胞系，系统注释了环状RNA的选择性反向剪接和选择性剪接事件，并将相关数据录入了CIRCpedia数据库。这项研究为人们提供了宝贵的资源，有助于探索环状RNA生成的复杂过程，揭示环状RNA在不同细胞中的潜在功能。

　　杨力研究员一直走在环状RNA领域的前沿。2014年他和陈玲玲研究员在Cell杂志上发表文章指出，是内含子的互补序列介导了外显子环化。环状RNA的生成机制主要有两种模型：套索驱动的环化和内含子配对驱动的环化。这项研究为内含子配对驱动环化提供了有力支持，证实是内含子的互补序列介导了外显子环化，生成的选择性环化产物进一步扩大了哺乳动物转录后调控的复杂性。

　　今年三月，杨力研究员领导团队在小鼠和人类基因组中鉴定了潜在的环状RNA衍生假基因。这项发表在Cell Research杂志上的研究表明，环状RNA发生反转录转座可能生成一些假基因，通过增加CTCF结合位点重塑基因组结构。而且这些假基因会在哺乳动物基因组中遗传下去。

　　迄今为止，科学家们对环状RNA的生成机制还知之甚少。中科院上海生命科学研究院的研究团队对此进行了深入研究。他们四月七日在Molecular Cell杂志上发表文章揭示了新生环状RNA的加工过程，文章通讯作者是陈玲玲研究员和杨力研究员。