Sci Rep：新型生物信息学软件或帮助预测癌症相关突变的效应

　　2016年7月5日讯 蛋白质由许多氨基酸链组成，每一种氨基酸链都会制造出一种名为功能性基序的短链氨基酸序列，当功能性基序被修饰时，产生的突变就会影响疾病的发展，比如癌症等疾病。验证蛋白质的可能性改变是深入理解其功能的第一步，人类机体的蛋白质组是由4万个蛋白组成，因此寻找每一种蛋白的突变将是一项非常艰巨的任务。

　　这就是为何科学家开始寻找生物信息学工具进行研究的原因，来自巴斯克地区大学的研究者此前开发了一种名为WREGEX的软件，其可以帮助预测并自动搜寻功能性的基序；研究者检测了这种软件预测基序的能力，基序可以将蛋白质从细胞核移动到细胞质中；如今研究人员想知道哪种蛋白质氨基酸序列中含有功能性的癌症突变基序。

　　刊登在Scientific Reports杂志上的一篇研究报告中，研究人员结合COSMIC目录中所有已知的人类蛋白质序列信息，并对相关信息进行了分许，COSMIC目录中收集了和癌症相关的突变，因此，基于最新版本的WREGEX 2.0软件，研究者就可以将正常蛋白同相同的突变体进行对比来帮助预测可以被修饰的蛋白质功能基序以及和癌症相关的功能基序。

　　研究者Gorka Prieto说道，你或许想知道基序发挥功能的机制，并且发现是否蛋白质的修饰和癌症相关，如今利用我们开发的新型软件或许就可以达到这些目的。文章中研究人员开发的新型工具结合了三种类型的信息，即蛋白质序列、功能基序及癌症突变，WREGEX 2.0软件的一个主要特性就是其可以同时研究携带大量蛋白质信息的高复复杂的蛋白质组，并且结合相关的信息，比如癌症突变信息等。

　　利用新型软件的优势就是可以在1分钟之内完成对4万个蛋白的分析，而其它软件程序分析单一蛋白都需要花费几分钟时间。利用这种新型软件科学家们或许就可以预测蛋白质的改变如何影响多种疾病的发生，而不仅仅是癌症。截至目前为止，来自中国、日本、德国等地的13个研究团队已经开始使用这种计算机工具，同时研究者希望后期可以进行更为深入的研究来改善这种工具的工作效率。