The Lancet Oncol：开发出首个诊断未知起源肿瘤的表观遗传学实验

　　2016年09月03日讯 通过近期研究表明，在癌症患者中，早期诊断通常包括原发肿瘤的检测以及转移性肿瘤的存在与否，原发肿瘤的细胞从它们的原始位置脱离后迁移到病人的其它组织中并继续进行生长。然而，在人类肿瘤的5%到10%之间的这一过程已经完成：转移性肿瘤被诊断出，但原发肿瘤通过各种诊断测试却没有被检测出来。这种情况被称为原发灶不明转移癌。肿瘤的类型是未知的，这些患者的生存时间是非常有限的。

　　“几年前，我们意识到化学模式可针对每个组织来调节基因的活性（表观基因组）。例如，相比肺癌细胞来说它们在胰腺癌细胞中是不同的。”Esteller博士说。“我们对超过10000种人类肿瘤的每种类型进行了分析，了解到它们特殊的表观遗传特征。我们现在研究了病人未知肿瘤起源的转移肿瘤的DNA，通过研究得到的表观基因组的影像告诉我们，它可属于胰腺癌，肺癌、结肠癌、乳腺癌等等家族，换句话也就是说，我们将会得出肿瘤起源的诊断结果。

　　通过表观遗传测试鉴别癌症的类型，将会对治疗的选择产生重大影响。“从现在开始，病人不会再进行盲目治疗，因为我们能够提供一个肿瘤类型的更特定的治疗方案。实际上，通过分析初始数据发现表明肿瘤患者幸存率是双倍的。”Esteller博士解释道。

　　表观遗传学简介

　　表观遗传学（epigenetics）是指不涉及DNA 序列改变的基因或者蛋白表达的变化， 并可以在发育和细胞增殖过程中稳定传递的遗传学分支学科， 主要包括DNA甲基化， 组蛋白共价修饰，染色质重塑，基因沉默和RNA 编辑等调控机制。

　　DNA甲基化简介

　　所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下， 在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个 甲基基团。正常情况下，人类基因组" 垃圾"序列的CpG二核苷酸相对稀少，并且总是处于甲基化状态，与之相 反，人类基因组中大小为100-1000 bp 左右且富含CpG二核苷酸的CpG岛则总是处于未甲基化状态，并且与56% 的人类基因组编码基因相关。人类基因组序列草图分析结果表明， 人类基因组CpG岛约为28890个，大部分染色体每1 Mb就有5-15个CpG岛，平均值为每Mb含10.5个CpG岛，CpG岛的数目与基因密度有良好的对应关系。