Nature：前所未有的海洋病毒

　　2016年09月21日讯 海洋虽然占了地球表面积的70%，但对于许多人来说仍然是陌生而神秘的。探索海洋，这也是许多研究人员的梦想。近日，一个国际研究小组分析了海洋中的病毒群体，以了解微生物群落在各种环境中的作用。这项成果于本周发表在《Nature》杂志上。

　　利用Malaspina科学考察和Tara海洋考察中获得的样本，研究人员分析了全世界的各个海洋采样点存在的双链DNA病毒，包括太平洋、大西洋、印度洋以及地中海。在这个过程中，他们分析了全球海洋病毒组（Global Oceans Viromes），大大扩展了全球海洋中发现的双链DNA病毒。

　　“我们的工作不仅提供了一份相对完整的海洋表面的病毒目录，还揭示了病毒调节温室气体排放和能源的新方式，”这篇文章的第一作者，俄亥俄州立大学的博士后Simon Roux谈道。

　　Tara海洋考察团队于今年的早些时候在《Science》杂志上发表论文，介绍了他们的初步考察结果，包括海洋中病毒、原核生物和微小真核生物的研究。当时，研究小组发现了海洋表层水域中近5,500种双链DNA病毒。

　　在这项新的分析中，Roux及其同事使用Illumina的HiSeq 2000测序系统，对90个海洋样本中的病毒颗粒开展宏基因组测序，这些样本是在Tara海洋之旅沿途的45个地点的不同深度中采集的。同时，他们也对2011年Malaspina科学考察中采集到的十多个样本进行类似的宏基因组测序。

　　通过9250亿个碱基的序列数据，研究小组发现这些深层带和中层带样本中存在15,222种双链DNA病毒。这些病毒聚为867类，每一类都或多或少与不同的病毒属相重合，包括38个特别丰富的聚类，它们出现在两个或多个采样地点。

　　之后，研究人员将重点放在病毒基因组的序列上。他们将研究的范围缩小到243个病毒基因，这些基因似乎编码了代谢相关的辅助蛋白。研究人员指出，部分基因似乎有助于硫和氮的循环过程。

　　这篇文章的通讯作者，俄亥俄州立大学微生物学系的Matthew Sullivan认为，这幅全球海洋病毒多样性的地图让人们了解到全球海洋中丰富的病毒。“结合最近的实验、生物信息学和理论进展，这一基础资源将帮助人们了解和预测病毒在自然界中的作用，”他说。