Oncotarget:对白血病研究常用细胞系进行测序 提高结果重复性

2017-03-01 08:49 来源:网友分享

  “突变是生命的一部分。基因中的突变就像文本信息中的排印错误,但究竟哪些突变会引发癌症?这是个问题。如果没有好的模型系统对突变进行检测就无法解决这一难题。”Watanabe-Smith博士这样说道。

  “我们对病人的DNA进行测序不仅要看已经知道的突变是否存在,还要寻找基因中的其他未知突变。而我们每次都会得到不同的突变结果。当我们在几例病人中发现相同突变后,我们就知道这个突变值得进一步研究。”Cristina Tognon博士这样表示。

  这项研究的重点在于介绍该实验室的模型系统,确保其他研究人员在寻找致癌突变的研究中能够使用准确且可重复的实验方法。

  该研究对一个常用的细胞系进行了分析,检测哪些突变对白血病和其他癌症的发生有重要作用。他们在研究中发现这个细胞系存在一个之前未报道过的缺陷,这个叫做Ba/F3的细胞系会获得额外突变。

  Watanabe-Smith指出:“潜在的影响就是无功能突变会变成有功能,如果是这样的情况那么可能得到的结果就不具有重复性。随后我们提出一个问题:细胞癌变的发生是因为从父母那里获得的一个突变还是因为从别处获得的新突变?”

  最终研究人员建议在用Ba/F3进行实验的过程中额外添加一步(对使用的细胞系进行测序)来提高结果的可重复性。虽然这些结果还需要得到更多研究证实,但是需要向科学界传递的信息已经很明确:在这个标准实验中存在一些之前没有预料到的潜在问题。

  “我们利用这种方法加深我们对癌症的理解。我现在对于哪些因素促进了白血病的发生以及哪些药物可以有效控制癌症有了更好的想法。” Watanabe-Smith这样说道。

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白血病是一类造血干细胞恶性克隆性疾病。克隆性白血病细胞因为增殖失控、分化障碍、凋亡受阻等机制在骨髓和其他造血组织中大量增殖累积,并浸润其他组织和器官,同时正常造血受抑制。临床可见不同程度的贫血、出血、感染发热以及肝、脾、淋巴结肿大和骨骼疼痛。据报道,我国各地区白血病的发病率在各种肿瘤中占第六位。更多>>

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