四川农业大学发表基因组测序重要研究

　　2016年09月20日讯 重测序揭示基因变异存在一定的局限，因为这种方法只能检验与参考基因组类似的序列。然而参考基因组往往是不完整的，也不能完全反映物种的遗传多样性。日前，四川农业大学的研究人员通过全基因组从头测序对猪（Sus scrofa）进行了更全面的遗传分析。这项研究于九月十九日发表在Genome Research杂志上，文章第一作者和通讯作者是四川农业大学的李明洲（Mingzhou Li）教授。

　　研究人员从头组装了欧亚大陆九种猪的基因组，这些猪在地理分布和表型上很有代表性。他们将自己获得的基因组序列与猪参考基因组进行比较，发现了大量新的SNP和结构变异。研究人员还为猪参考基因组补上了137.02 Mb的序列，这段序列包含1737个蛋白编码基因。这项研究展示了全基因组从头测序的力量，为人们提供了宝贵的遗传学资源，有助于在农业生产和生物医学研究中更有效的利用猪。

　　九月五日，浙江大学和Nebraska大学的科学家们在Nature Genetics杂志上发布了异源多倍体芥菜型油菜（Brassica juncea）的基因组序列。油菜在植物分类上属于十字花科芸薹属（Brassica genus），是世界广泛种植的油料作物。这类植物拥有三个二倍体基因组和三个异源多倍体基因组。这篇文章的通讯作者是浙江大学的张明方（Mingfang Zhang）教授和Nebraska大学的Sally A Mackenzie。

　　人类基因组是包含六十多亿DNA碱基的复杂序列。现在测序一个人的基因组已经比较方便了，但随之而来的基因组分析问题依然令人头疼。为了提高基因组分析的质量，澳大利亚Garvan医学研究所的团队开发了Sequins技术。他们在八月八日的Nature Methods杂志上连发两篇文章对这个技术进行了详细的介绍。

　　今年七月，暨南大学和南加州大学的研究人员通过长读取测序技术从头（de novo）装配了一个高质量的中国人基因组。这项研究成果发表在Nature Communications杂志上，文章通讯作者是南加州大学Kai Wang教授、暨南大学粤港澳中枢神经再生研究院的苏国辉（Kwok-Fai So）教授和周立兵（Libing Zhou）教授。