陈士云研究组最新文章解析小RNA调控机制

2016-08-01 10:25 来源:网友分享

  2016年07月31日讯 小RNA(Small non-coding RNA, sRNA)是细菌重要的转录后调控因子,广泛参与调控细菌各方面的功能。由于不同sRNA调控的靶标及其调控机制不相同,多数已鉴定sRNA 的靶基因未知,且一些已知靶基因的sRNA 是否存在新的调控靶标及调控机制也不清楚,因此sRNA一直是原核生物调控型RNA研究的热点。

  近期,中国科学院武汉病毒研究所研究员陈士云带领的病原细菌学科组在sRNA功能及调控机制研究方面取得进展。该研究以临床重要的机会致病菌--铜绿假单胞菌为对象,通过生物信息学等方法鉴定出依赖于细菌压力耐受因子RpoS的sRNA-RgsA的2个调控靶标:酰基转运蛋白AcpP及全局性调控蛋白Fis;在伴侣蛋白Hfq的辅助下,RgsA通过不完全互补配对方式调控这2个靶标的表达。

  进一步研究发现,fis mRNA有两个起始密码子,且均受到RgsA的调控,并找到了调控的关键区域。RgsA还通过抑制细菌生长、运动性及促进毒素的分泌,参与调控细菌的毒力及生长等表型。该研究首次将全局性转录调控因子Fis与压力相关因子RpoS通过sRNA的调控联系起来,揭示了细菌在应对外界环境信号及压力条件时,RgsA反馈调控AcpP和Fis这2个靶标的具体机制。

  该研究由助理研究员卢培等人完成,论文在线发表在《分子微生物学》(Molecular Microbiology)。该研究得到国家自然科学基金青年基金项目的资助。

  小分子RNA简介

  MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本(primary transcripts miRNA,pri-miRNA),在核糖核酸酶Drosha的作用下剪切形成约60-70nt 的发卡状miRNA前体(或者称为pre-miRNA),然后Ran-GTP /Exportin 5将pre-miRNA转运到细胞质,随后,另一个核糖核酸酶Dicer将其剪切成约为20-24个核苷酸长度的miRNA :miRNA双链。这种双链很快被载入RNA诱导沉默复合体(RISC)中,之后其中一条单链miRNA被降解,另一条成熟的单链miRNA分子通过与靶mRNA序列互补配对,来调节基因的表达。

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