MIT顶尖学者Jaenisch实验室《Cell》发布基因组DNA甲基化编辑技术

　　2016年09月23日讯 9月22日晚，《Cell》发表了一篇来自MIT顶级学者Rudolf Jaenisch实验室题为“Editing DNA Methylation in the Mammalian Genome”的重磅文章。

　　众所周知，近几年来CAS9基因编辑技术的广泛使用使得很多以前很难完成的实验想法得以轻松完成，充分显示了CAS9的强大威力。也许基因组范围的基因编辑大家很熟悉，但是近一年来有关表观基因组的基因编辑方兴未艾，目前世界上很多实验室在开始在这个方向进行努力突破。

　　我们知道，DNA甲基化是表观遗传学领域中最重要的研究方向之一。但是如何在特定区域实现精准的DNA甲基化编辑，长期以来都是一个难以解决的问题。不过，今年5月3日，来自中科院上海生化细胞所的胡荣贵研究员课题组在《Cell Discovery》（Cell Research姊妹刊，定位为PNAS，EMBO等水平）发表了一篇题为“A CRISPR-based approach for targeted DNA demethylation”的研究成果，该项研究成果采用CRISPR-CAS9系统，通过向传统sgRNAs中插入双拷贝的噬菌体MS2 RNA元件，构建了修改的单导向RNAs（sgRNAs）（sgRNA2.0），从而有利于Tet1催化结构域（TET CD）与dCas9或MS2外壳蛋白融合，进而结合到特定基因位点行驶DNA去甲基化功能。

　　而就在8月29号，《Nature Biotechnology》在线发表了一篇来自日本科学家的研究成果，题为“Targeted DNA demethylation in vivo using dCas9-peptide repeat and scFv-TET1 catalytic domain fusions”。该研究成果和胡荣贵研究组的文章大同小异，思路上差不多，但是实验结果要更完备清楚一些，而且实验效率比较高，并且在多种细胞系和小鼠胎儿中实现了。这篇文章比《Cell Discovery》要早投稿两个月。

　　比较有意思的是，今年6月份还有一篇发表在《Oncotarget》上题为“CRISPR-dCas9 mediated TET1 targeting for selective DNA demethylation at BRCA1 promoter”的文章利用上述相似的技术实现了BRCA1基因启动子区域的DNA去甲基化。最近oncotarget杂志名声不好，特别是近段时间该杂志发表了大量国内一些灌水文章，新的IF也下降了，搞得不少人认为一个新的Plos One出现了，不过这篇文章的水准肯定大大超过了杂志的要求了，的确是一篇非灌水的同类优秀文章。

　　最后再说说刚刚发表的这篇《Cell》，这篇文章的投稿日期是3月3号，比上述的oncotarget投稿时间也就早了一个星期。不过，牛老板就是牛啊，尽管前面有类似文章发表，该发Cell一点都不含糊。Cell终究是Cell啊，除了“做工精细”是自然，内容也是更加丰富了，除了特异位点DNA甲基化的去除还可以在特定位点实现DNA甲基化。最重要的是在小鼠中也能很好的实现。该篇文章还有一大亮点就是 提供了详细的实验步骤，Cell真贴心。Rudolf Jaenisch实验室的CAS9技术一向玩的很棒，Cell也是呼呼的出。他们实验室下一步是不是还要实现特定位点组蛋白修饰？让我们拭目以待吧。