两院士携手Nature Genetics发布基因组研究重要成果

2016-07-23 21:17 来源:网友分享

  2016年07月20日讯 来自云南大学、中科院昆明动物研究所、中科院北京基因研究所等10多家研究机构的研究人员,在新研究中对金丝猴进行了基因组分析,鉴别出了与高海拔适应相关的一些基因和过程。

  张亚平院士主要从事基因组多样性研究。吴仲义院士自80年代以来则一直从事群体遗传学的研究。2013年,两位院士曾携手合作在Nature Communications杂志上发表了一项重要的成果,证实人和狗的数组基因,其中包括与饮食和消化、神经学过程和疾病相关的基因,在数千年的时间里一直在平行进化。这种平行进化有可能是受到人类和狗共享环境的驱动。

  金丝猴仰鼻猴属(genus Rhinopithecus)包括5个近亲物种:滇金丝猴、川金丝猴、黔金丝猴、越南金丝猴和缅甸金丝猴,它们在早更新世时期发生分歧。这5个物种都是世界上最珍稀及最濒危的灵长类动物,仅分布在中国和越南独立地区一些非常有限的区域(金丝猴属种存在于中国的首个照片证据 )。

  2014年,中国科学院动物研究所与禾致源共同合作,在国际上率先完成了金丝猴的基因组序列图谱的构建,为解析金丝猴适应植食性的分子机制、系统发育和进化提供了遗传基础,该研究发布于Nature Genetics杂志上。目前研究已报道获得了川金丝猴的参考基因组,和除越南金丝猴以外所有物种的基因组重测序数据(Nature Genetics:中国科学家破译金丝猴基因组 )。

  除了它们的保护价值,仰鼻猴物种在适应性进化方面也非常独特。除了以植食性为主且独立发展出具有类似反刍动物的复杂的胃,食叶猴和牛的溶菌酶与核糖核酸酶(RNase)还显示出分子趋同现象。仰鼻猴物种分布于800 - 4,500 m的海拔高度。黔金丝猴和越南金丝猴分别居住在中国贵州省和越南北部<2,000 m的低地区域,而滇金丝猴、川金丝猴和缅甸金丝猴则生活在海拔高度>3,000 m的高原区域,包括青藏高原和中国中部的一些山区。仰鼻猴属不仅为调查非人类灵长类动物对高原的适应机制,还为探究不同高原区域适应性机制之间的不同与相似之处提供了一个有趣的研究模型。

  在这篇文章中,研究人员报告了对滇金丝猴进行了从头全基因组测序,并对另外4个物种进行了基因组测序。在与高海拔金丝猴肺功能、DNA修复和血管生成相关的6个基因中发现了8种共享的替换。功能分析揭示高海拔CDT1变体(Ala537Val)使得细胞更加耐受紫外光照射,高海拔的RNASE4变体(Asn89Lys和Thr128Ile)使得体外诱导内皮管形成的能力增高。研究人员对滇金丝猴和川金丝猴种群进行基因组扫描,在与高海拔适应相关功能有关联的一些基因上鉴别出了一些种群间与种群内的选择标记。

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