Cell文章揭示重要的lincRNA

　　2016年07月23日讯 麻省大学医学院的一个科学家小组发现了，负责调控天然免疫的一种长链非编码RNA：lincRNA-EPS。这项研究发布在《细胞》（Cell）杂志上。

　　在巨噬细胞中大量表达的lincRNA-EPS，将触发炎症的一些基因维持在关闭状态直至遭遇到病原体。这一研究发现指出了lincRNAs在免疫系统中从前未知的一种作用，有可能促成对失控性免疫反应引起的一些炎症疾病，如红斑狼疮或炎症性肠病的新认识。

　　研究的资深作者、医学教授Katherine A Fitzgerald说：“这些研究结果表明了一个尚未探索的控制炎症和免疫反应的调控层面。我们已证实了一种lincRNA在免疫系统中发挥重要的功能。”

　　为了区别它们与microRNA、siRNA、piRNA和其他的小分子RNA，长链非编码RNAs被定义为是长度大于200个核苷酸的一类非蛋白质编码转录物。人们认为lincRNA可能控制了人类基因组中大多数的RNA转录。Fitzgerald说：“尽管它们含量丰富，当前对于这些长链RNAs在免疫系统中的功能所知甚少。免疫学家们在试图了解控制免疫系统的复杂遗传环路时，一直都将焦点放在基因组2%的蛋白质编码区域上。”

　　利用缺失lincRNA-EPS的小鼠模型，Fitzgerald和同事们证实在正常状态下，抵御感染的一种白细胞：巨噬细胞生成lincRNA-EPS阻止了自发性激活一些免疫反应基因。然而，当巨噬细胞检测到一种潜在病原体时，lincRNA-EPS表达受到抑制松开这一刹车，启动了促炎症反应。缺失的lincRNA-EPS小鼠显示细胞因子和炎症反应水平增高，导致了中毒性休克。

　　研究人员发现lincRNA-EPS通过控制核小体的位置使得一些免疫基因无法接近，抑制了它们表达。当lincRNA-EPS不再在这些细胞中表达时，基因组结构发生改变，由此一些至关重要的免疫相关基因会暴露出来进行转录。当研究人员将lincRNA-EPS重新导入到巨噬细胞中时，免疫基因的表达会恢复至正常水平。

　　论文的第一作者、麻省大学医学院博士后研究人员Maninjay K. Atianand说：“我们还发现lincRNA-EPS表达自身受到非常精细地调控，对于微小的改变非常敏感。这一lincRNA是阻止自发性激活关键免疫基因的这一分子回路中一个重要的组件。这些研究发现重要地暗示了lincRNAs在慢性炎症和免疫病理变化中的潜在作用。

　　下一步Fitzgerald和同事们打算确定lincRNA-EPS在肠炎中所起的作用，以及它在丰富表达的结肠中发挥的功能。

　　中国医学科学院北京协和医学院的研究人员在新研究中揭示，在基因间长链非编码RNA （lincRNA） LINC00673中的一个胰腺癌风险变异为miR-1231构建了一个结合位点，干扰了PTPN11降解。这一重要的研究发现发布在2016年5月23日的Nature Genetics杂志上（林东昕院士Nature Genetics揭示抑癌lincRNA ）。

　　斯坦福大学医学院的研究人员发现，古代病毒感染留下的遗传学物质lincRNA在人类发育过程中起到了非常关键的作用。受精的人类卵细胞需要这样的非编码RNA，才能在早期发育中获得多能性。阻断这些RNA分子的生产，发育就无法继续进行。这项研究发表在2015年11月的Nature Genetics杂志上（Nature遗传学：决定多能性的lincRNA ）。

　　2015年10月，来自中科院昆明动物研究所、中国农业科学院的研究人员调查了来自3个猪品种脂肪和肌肉组织中全基因组范围长链基因间非编码RNA的DNA甲基化水平。研究结果发布在《Scientific Reports》杂志上（张亚平院士等：解析lincRNA的DNA甲基化）。